1、首先，精種的分離是整個工作的第一個關鍵步驟，分離培養(yǎng)基的確定，分離培養(yǎng)條件的選擇，如培養(yǎng)溫度、濕度、好氧或厭機培養(yǎng)等，在分離的最初階段一般不給予嚴密的培養(yǎng)條件，盡可能分離到盡可能多的純菌種 。
2、在這種情況下，在菌種的分離階段可以選用廣泛的分離培養(yǎng)基，各種分離培養(yǎng)基中還應針對性地加人目的酶產(chǎn)生菌的作用底物 。分離對象可包括細菌、真菌、酵母菌及放線菌等 。
3、分離條件也應做到多樣化，比如吸取的土樣稀釋液量的控制、不同的培養(yǎng)溫度選擇等 。分離到的單菌落應立即轉移到分離成分一致的新鮮斜面上，等獲得純培養(yǎng)之后就可著手進行初篩 。
4、菌種的初篩有兩種方法，用簡單的定性反應進行初篩，在最初分離階段就給予特殊的培養(yǎng)基或培養(yǎng)條件 ， 進而讓目的菌株得以繁殖，盡可能地把只成為目的菌的菌株或只將其最適菌株的一株純化分離 ?？傊?，初篩的目的就是要用最簡單和最快捷的方法來對大量的待篩菌進行測試 。
5、目的酶產(chǎn)生菌高產(chǎn)突變體的獲得，高產(chǎn)突變菌種有著十分重要的意義 。首先 ， 高產(chǎn)突變株常常能夠比親株產(chǎn)生高出很多倍數(shù)量的酶 。在另外一些情況下，突變株能夠產(chǎn)生比較少的不需要的酶或其他代謝產(chǎn)物 ， 因而有利于酶的回收和提純 。
【純化菌種的方法】6、最后，獲得高產(chǎn)突變株的方法，采用物理和化學因子來處理微生物 ， 并使其發(fā)生變異 。常用的化學誘變劑有氮介子氣、亞硝酸、硫酸二乙酯、環(huán)氧乙燒、乙烯亞胺等 。物理因子有: 紫外線、X射線、7 射線等 。另外，還有其他的一些方法 。

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